WP3
Structure et Évolution des Génomes de Plantes Apomictiques
Quels sont la nature et le rôle fonctionnel des régions génomiques spécifiques de l’apomixie?
Participants
CNR (Coordinateur), IRD, NIAB, UZH, UNIPD, CONICET
Objectifs
Le WP3 met en œuvre 64 mois de détachement consacrés à la recherche et à la formation. Son objectif principal est de déchiffrer les caractéristiques structurelles et fonctionnelles de la région contrôlant l’apomixie (ACL pour Apomixis Controlling Locus) chez deux graminées fourragères des genres Eragrostis et Paspalum, et de proposer un schéma général de l’architecture fonctionnelle des génomes apomictiques.
Les actions proposées visent à déterminer, et comparer, le contenu en gènes des régions ACL chez Eragrostis et Paspalum, à identifier les gènes clefs de la reproduction apomictique, et à proposer des hypothèses quant à l’évolution des génomes apomictiques depuis leur divergence avec leurs ancêtres sexués.
Livrables
D3.1: Régions homéologues de l’ACL chez des plantes sexuées de Paspalum et Eragrostis et, liste de gènes candidats.
D3.2: Liste des gènes produisant des variants d’épissage alternatif chez plantes apomictiques.
D3.3: Structure et évolution de la région ACL chez Paspalum et E. curvula et annotation fonctionnelle pour les gènes qui y sont localisés.
D3.4: Caractérisation des phénotypes reproducteurs de lignées dont l’expression de gènes candidats a été modifiée par transgénèse chez Paspalum spp. et E. curvula.
D3.5: EProfil épigénétique de gènes candidats dans les tissus floraux de plantes apomictiques et sexuées chez Paspalum et Eragrostis.
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