Comisionados

El término “período de misión” o “secondment period” se refiere al lapso en el que un miembro de alguna de las instituciones de la red permanece en una organización hospedadora, con el propósito de cumplir los objetivos del proyecto. Un comisionado o “secondee” es el miembro de alguna de las instituciones de la red que es albergado en la institución hospedadora.

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Debido a la prohibición de traslados durante la actual pandemia de COVID-19, todas las misiones de MAD han sido postergadas. Según las políticas y las circunstancias vayan cambiando, esperamos poder iniciar los intercambios internacionales hacia el final de 2021.

2022

Dr. Diego Zappacosta

Bahia Blanca, Argentina, CERZOS

University of Perugia (Italy), del 1 de marzo 2022 al 7 de mayo 2022

El objetivo de esta comisión de servicio es continuar con el ensamblaje de los genomas tetraploides de Eragrostis curvula para determinar el locus que controla la apomixis y estudiar la evolución del genoma en esta gramínea (WP 3). Durante estos dos meses, analizaré, en colaboración con el grupo de la UNIPG, las relaciones genéticas entre el diploide sexual (Victoria), previamente secuenciado y publicado por las 2 instituciones, y el tetraploide apomíctico cv. Tanganyika. Primero ensamblaremos un pan-genoma y lo resolveremos en el genoma central y el genoma prescindible. Se ensamblarán las lecturas mapeadas en la referencia Victoria, mientras que las lecturas no mapeadas se ensamblarán de novo para analizar las variaciones de presencia/ausencia. A continuación, analizaremos los genes ortólogos para encontrar contracciones y expansiones de familias de genes y compararemos las regiones que controlan la apomixis en Eragrostis y Paspalum spp. Además, aplicaré el protocolo MCSeEd desarrollado por UNIPG para comparar las regiones metiladas diferencialmente entre los genotipos apomícticos y sexuales (Task 3.3).

Juan Manuel Vega

Rosario, Argentina, IICAR

IRD, Montpellier (France), del 19 de abril 2022 al 18 de junio 2022

Esta comisión de servicio forma parte del esfuerzo emprendido por el proyecto MAD (ver objetivos del WP3) para determinar la naturaleza, la evolución y el papel funcional de la región de control de la aposporía (ACR) en Paspalum notatum. Aprovechando un genoma diploide de referencia y conjuntos de datos de lecturas largas disponibles para apomícticos tetraploides, primero utilizaré el método “adaptative sampling” que ofrece la plataforma ONT para enriquecer la secuenciación de lecturas largas de ACR y luego realizaré un ensamblaje de alta cobertura tanto para un apomíctico obligado como para un apomíctico facultativo. También se aplicarán estudios complementarios mediante el uso de métodos open source destinados a identificar y filtrar las variaciones estructurales.  En conjunto, esto debería permitir estudios de genómica estructural y comparativa para determinar el contenido genico y la capacidad de codificación/regulación dentro del ACR y proporcionar pistas sobre su papel funcional en la aparición de la apomixis en Paspalum.

Dra. Carolina Colono & Prof. Silvina Pessino

Rosario, Argentina, IICAR

University of Milan (Italy), del 29 de abril 2022 al 2de julio 2022

Del 29 de abril al 2 de julio de 2022 la Dra. Carolina Colono y la Prof. Silvina Pessino visitarán el laboratorio de la Prof. Lucia Colombo en la Universidad de Milán, para explorar el papel del control hormonal en la transición de la sexualidad a la apomixis utilizando la planta modelo Arabidopsis thaliana.

De izquierda a derecha: Carolina Colono, Silvina Pessino y Lucia Colombo

Dr. Juan Pablo A. Ortiz

Rosario, Argentina, IICAR

IBBR (Italy), del 5 de mayo 2022 al 6 de junio 2022

El 9 de mayo comienza una nueva comisión de servicio del MAD de un mes de duración en la que participan investigadores de Argentina e Italia. En efecto, el Dr. Juan Pablo A. Ortiz del IICAR, (CONICET-UNR) está visitando el laboratorio del Dr. Fulvio Pupilli en el Instituto de Biociencias y Biorecursos (IBBR-CNR) de Perugia. El plan de trabajo se centra en el análisis funcional de ORC3, un gen que se segrega completamente ligado a la apomixis, en la formación del endospermo de semillas apomícticas de Paspalum simplex. Además, también se pretende avanzar en el ensamblaje y la caracterización del genoma de P. simplex utilizando lecturas de secuencias largas generadas con la tecnología Oxford Nanopore. Los miembros del grupo del Dr. Pupilli que participan en este proyecto son: Dra. María Eugenia Cáceres, Dr. Andrea Rubini, Dra. Francesca De Marchis y Dr. Michele Bellucci. Al final de la comisión de servicio, se espera haber completado la redacción de un manuscrito sobre el análisis funcional de PsORC3 y producido un borrador del ensamblaje del genoma de P. simplex.

Fulvio Pupilli (izquierda) & Juan Pablo A. Ortiz (derecha)